1、审计长是审计署的行政首长。审计署自1983年成立以来，先后有四任审计长，其任期分别是： 于明涛 1983年6月至1985年3月
吕培俭 1985年3月至1994年5月
郭振乾 1994年5月至1998年3月
李金华 1998年3月至今
2、审计署机关编制352人，共设置14个厅、司，其中，综合部门5个，业务部门9个。
还设有不列入机关公务员编制的后勤部门和直属事业单位7个。
审计署根据工作需要，在国务院各部门、直属事业单位设有25个派出审计局，编制316人；在全国18个中心城市设有特派员办事处，编制2710人。派出审计局和特派员办事处均由审计署垂直领导，人、财、物等由审计署直接管理，对审计长负责并报告工作，具体工作事项同审计署有关司对口联系和管理。
3、派出审计局的主要任务是，负责审计国务院各部门、直属事业单位及其在京下属单位的财政财务收支。
特派员办事处的主要任务是，负责审计省级财政决算，海关、国税和中央国库驻地方分支机构的财务收支，中央国有金融机构和国有企业的资产、负债和损益，中央直属事业单位的财务收支，以及国家重点建设项目的预算执行情况和决算。
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