对一个国家或地区而言，其财政收支活动可以划分为两个环节，即组织财政收入和安排财政支出。国家通过征税等措施集中一部分社会财富，并将其用于发展国防、外交、科技、教育、文化、卫生等事业及基础设施建设等，从而为国家职能的实现提供物质保障。与此相适应，财政审计也可以分为财政收入审计和财政支出审计。在国家财政支出中，用于维持政府机构正常运转，发展社会公益事业的行政事业支出占相当大的比重，这些支出对于社会的稳定和持续发展具有十分重要的意义，因此，行政事业审计是财政支出审计的重要内容。
一、行政事业审计的概念
行政事业审计是审计主体依法对行政事业单位的财政、财务收支及其相关经济业务活动进行审查，以监督、评价其真实性、合法性和效益性，以及有关经济资料的真实性和公允性的独立经济监督活动。
行政事业审计的主体是国家审计机关、社会审计组织和内部审计机构，而以国家审计机关为主。根据《中华人民共和国审计法实施条例》的规定，审计机关对与本级人民政府财政部门直接发生预算缴款、拨款关系的国家机关、军队、政党组织和社会团体，依法进行审计监督；对与本级人民政府财政部门直接发生预算缴款、拨款关系的企业和事业单位，依法进行审计监督。对行政事业单位审计是国家审计机关的法定职责。
行政事业审计的对象或客体，是行政事业单位的财政财务收支。顾名思义，行政事业单位是指行政单位和事业单位，行政单位包括各级行政机关和实行预算管理的其他机关、党政组织；事业单位是指各级各类国有事业单位。行政事业单位多具有行政管理职能或对国家、社会的稳定和发展具有重要的服务功能，国家的宏观经济政策、方针要通过它们的业务活动来体现和实施，特别是一些经济管理部门，其资金分配、资金使用、制定政策等情况对国民经济能否健康、持续发展具有很大的影响。这就决定了行政事业审计是一种高层次的、宏观性的审计监督。
二、行政事业审计的职责
(一)行政事业审计的范围
根据《中华人民共和国审计法》及其实施条例的有关规定，国家审计机关对本级各部门(含直属单位)和下级政府预算的执行情况和决算，以及预算外资金的管理和使用情况进行审计监督；审计机关对国家事业组织的财务收支进行审计监督。具体而言，行政事业审计的范围可以概括为：
1.对与本级人民政府财政部门直接发生预算缴拨款关系的国家机关、政党组织、社会团体进行审计监督。其中国家机关指本级人民政府的组成部门、同级人大、政协及其职能部门；政党组织指同级中国共产党机关及其职能部门和向同级政府财政部门领取经费的民主党派机关及其职能部门；社会团体如工会、各种协会、妇联等等。
2.对与本级人民政府财政预算有财务收支关系的事业单位进行审计监督。事业单位主要指本级人民政府直属的国家事业组织。
3.对预算外资金的管理和使用情况进行审计监督。接受行政事业审计监督的预算外资金，是国家机关、事业单位和社会团体为履行或代为履行政府职能，按照国家有关规定收取、提取和安排使用的未纳入预算管理的财政性资金，主要包括行政机关和事业单位未纳入预算管理的各项行政收费和事业收费、政府有关部门从所属单位集中的上缴资金及其他未纳入预算管理的财政性资金、基金。
(二)行政事业审计的职责
行政事业审计的职责可以概括如下：
1.行政部门、事业单位的预算执行审计。行政事业审计的一个重要职责是参加预算执行审计。财政预算执行情况可以粗略地分为财政收入预算执行情况和财政支出预算执行情况两个部分。在同级财政支出预算中，用于维持政府部门运转和发展科教文卫等公益事业的行政事业经费占有相当大的比重。在财政预算执行情况审计中，行政事业审计主要是对同级财政支出预算中的行政事业经费预算执行情况和其他有关财政财务收支进行审计，也就是对与本级人民政府财政部门直接发生预算缴拨款关系的国家机关、政党组织、社会团体经费预算执行情况和其他财政财务收支情况进行审计监督。
2.财政财务收支审计。预算执行审计是一种全范围的审计，着眼于从全局反映一级财政预算执行的整体情况。为掌握特定部门、单位财政财务收支情况，行政事业审计还经常根据需要对有关政府部门、政党组织、社会团体和事业单位的财政财务收支进行定期或不定期的审计，以监督、评价该部门、单位财政财务收支的真实性、合法性和效益性。
3.专项审计。行政事业审计中除对单位的预算执行情况和财政财务收支情况进行审计外，还常常根据需要对某一项经费或资金的管理使用情况立项进行专门审计。专项审计的对象既包括财政安排的经费、纳入预算管理的财政性资金，也包括未纳入预算管理的财政性资金。常见的有教育经费审计、科技经费审计、行政性收费和罚没收入审计等等。这种审计方式具有很强的针对性，集中反映某一专项经费来源、管理、使用的基本情况，便于发挥国家审计的宏观经济监督作用。
4.专项审计调查。审计机关可以在其职责范围内，对与国家财政收支有关的特定事项开展专项审计调查。
5.财经法纪审计。为严肃财经法纪，促进党风和廉政建设，行政事业审计要对其职责范围内违反财经法律、政策的部门、单位和个人进行专案审计。
三、行政事业审计的目的和意义
(一)行政事业审计的目的
行政事业审计的目的是保证行政事业单位财政财务收支的真实性和合法性，提高财政性资金的使用效益。行政事业审计的目标具有两个方面的含义：首先，保证财政财务收支的真实性和合法性与提高财政性资金的使用效益是行政事业审计目的的两个层次。提高资金的使用效益是审计的最终目的，而保证被审计单位财政财务收支的真实性和合法性是达到这一最终目的的关键所在。这是因为一切经济活动的最终目的都是使有限的经济资源发挥最大的效益，审计作为一种经济监督活动，其最终目标与此是一致的，只有保证了被审计事项的真实性和合法性，才能保证资金的使用符合法律法规、计划的要求，资金才能发挥预期的效益，因此保证被审计事项真实性、合法性是基础层次的审计目的。其次，这两个层次的目的又是统一的整体，真实性和合法性本身也是效益性的重要方面，被审计单位只有按法律、法规的规定使用资金，才能使资金发挥预期的效用，否则资金的效益就无从谈起，真实性、合法性与效益性在具体的审计项目中应该是统一整体的不同方面，因此，行政事业审计的目的是对财政性资金的使用效益进行评价，对被审计事项的真实性、合法性进行检查是达到这一目的的必要前提和手段，审计中应首先对财政财务收支的真实性和合法性进行检查，在此基础上，对财政性资金使用效益进行评价，二者不可或缺。
(二)行政事业审计的意义
经济越发展，审计越重要。随着我国经济体制改革的深入和社会主义市场经济体制的建立与完善，作为上层建筑，行政事业单位在国民经济运行中的作用发生了很大的变化，其管理、调控和服务功能日益重要。为了保证其职责的有效履行，需要对其进行监督。作为国家审计的一部分，行政事业审计在维护法律尊严、促进党风廉政建设、为改革开放和宏观调控服务等方面发挥了重要的作用。行政事业审计的意义主要有以下几点：
1.保障国有资产的安全和完整。通过审计，摸清行政事业单位的财政财务收支规模、来源渠道和使用方向，发现和揭露行政事业单位财政财务收支活动中存在的违法违纪问题，防止国有资产流失。
2.促进廉政建设。目前，干部队伍的腐败已经成为我国经济和政治生活中亟待解决的问题，通过审计，可以发现和揭露以权谋私、贪污腐败等问题，严肃财经法纪，促进党风廉政建设。
3.提高财政性资金的使用效益。通过审计，可以发现和揭露资金使用不合理或损失浪费的问题，提出审计建议，促进被审计单位加强管理，提高财政性资金的使用效益。
4.为国家宏观调控服务。这一作用主要体现在两个方面：第一，保证国家宏观调控政策的落实。行政事业单位属于上层建筑范畴，行政机关负有国民经济的行政管理职能，事业单位的业务活动对发展科技、文教等事业，促进国民经济的协调发展具有重要意义。适应社会主义市场经济的要求，行政事业单位对国民经济发展的上述重要职能越来越多地通过经济手段来实现，即运用国家掌握的经济资源，通过市场机制的作用对国民经济运行进行管理和调控。这就必然要求行政事业单位按法律、法规和国家发展规划的指向开展业务活动。通过审计，无疑有助于及时发现行政事业单位在执行国家法律法规、方针政策中存在的问题，保证国家宏观调控措施的落实和国民经济的持续、稳定、健康发展。第二，为国家制定宏观政策提供依据。通过审计，能够掌握行政事业单位财政财务收支活动真实情况，发现宏观经济管理中带有普遍性的问题，为国家有关部门制定政策提供可靠的信息。四、行政事业审计的主要类型和审计内容
行政事业审计按不同的标准可以划分为不同的类型，一般来说，按审计对象可分为行政单位财政财务收支审计和事业单位财政财务收支审计；按审计范围可分为全面审计和专项资金审计；按审计规模可分为对单个审计对象的审计和行业审计等等。下面将行政事业审计中较为常见的审计类型的制度背景和主要审计内容等作一简要介绍。
(一)行政单位财政财务收支审计
1.行政单位财务管理制度的主要内容。
根据现行制度，行政单位实行收支统一管理，定额定向拨款，超支不补，结余留用的预算管理办法，各项收支统一纳入单位预算管理，统筹安排使用。行政单位应定期向同级财政部门或上级预算单位报送收支预算，请领经费，按批准的预算组织实施，并定期向财政部门或上级预算单位报告预算执行情况。行政单位的收入，主要有财政预算拨款收入、预算外资金收入及其他合法收入。行政单位是国家行政管理部门，其收入主要来源于财政预算拨款，即行政经费。为弥补财政经费的不足，行政单位也可以自行组织一些收入，即预算外资金收入。按现行制度规定，行政单位取得的预算外资金收入必须实行财政“收支两条线”管理，即将收入缴入财政专户，支出时向财政报送支出计划，经财政审核后拨付款项，办理支出。行政单位的预算外资金收入即指财政部门根据行政单位提出的支出计划，按有关规定核拨给行政单位的预算外资金和经财政部门核准、由行政单位按计划使用、不上缴财政专户的少量预算外资金。应注意的是，行政单位依法取得的，应纳入财政预算的罚没收入、行政性收费和基金，以及应缴入财政专户的预算外资金，不属行政单位收入，必须及时足额上缴。其他合法收入是指行政单位依法取得的其他收入。行政单位的支出包括经常性支出、专项支出和自筹基建支出。经常性支出是指行政单位为维持正常运转和完成日常工作任务发生的支出，如人员工资、办公费、差旅费等等；专项支出是为完成专项或特定工作任务发生的支出；自筹基本建设支出指行政单位经批准用财政预算拨款以外的资金安排的基本建设支出。行政单位收支相抵后的余额，为结余，分为经常性结余和专项结余，全额结转下年使用。行政单位应建立、健全资产管理制度，由财务部门统一建帐核算，资产管理部门统一登记、管理并定期或不定期进行清查盘点，保证帐帐相符，帐实相符，以保护国有资产的安全完整。
2.行政单位财政财务收支审计的主要审计内容。
(1)内部控制制度的评审。行政单位应建立、健全有效的内部控制制度，从制度上降低发生违纪违规问题的可能性，保证财政财务收支活动的真实性和合法性。审计人员要对行政单位的内部控制制度进行检查、评价，就内部控制制度的不足之处提出审计建议，帮助被审计单位加强管理，并根据内部控制制度评审结果确定审计的重点。主要检查两方面的内容：一是内部控制制度的健全性，即被审计单位是否在需要控制的所有主要环节均建立了控制制度，内部控制制度的设置是否符合有关法律、法规和制度的规定，制度能否有效防止违纪违规行为，保证单位业务目标的实现；二是内部控制制度的有效性，即已建立的制度是否得到了执行，并取得相应的效果。
(2)预算编制情况。行政单位实行严格的预算管理，国家对行政机关的人员、房屋、车辆等编制及各项支出的标准均有明确规定，行政机关必须按照核定的编制和费用开支标准编制预算，并及时报送财政部门或上级预算单位。审计中主要审查：预算的编报是否及时，有无迟报的问题；预算的编制是否真实、正确，有无虚列预算，骗取国家拨款的情况，有无突破国家规定的开支标准的问题；有无编制赤字预算的问题。
(3)预算执行情况。行政单位应严格执行预算，并定期向同级财政部门或上级主管部门报告预算执行情况。主要审计内容：预算批复和拨款到位情况，财政部门、上级主管部门是否按规定批复预算并办理拨款，有无预算批复不及时，占压拨款的情况；预算分配和转拨经费的情况，行政单位是否按财政部门批复的预算向所属预算单位分配预算并转拨经费，有无不按规定的预算级次拨款的问题；预算执行情况，经费使用是否符合预算，有无超支、各预算项目之间互相挪用的情况，并分析其原因；经费使用是否符合规定的用途和开支标准，有无挤占挪用、提高开支标准、扩大开支范围、挥霍浪费的情况；经费开支是否真实，有无虚列支出，私设“小金库”等问题；有预算上缴任务的行政单位是否及时足额上缴应缴预算收入，有无隐瞒收入，截留、占压、挪用应缴预算收入等问题。
(4)预算外资金管理情况。近年来，预算外资金规模增长很快，有的地方或部门的预算外资金收入已经接近或超过预算收入，成为地区或部门的重要收入来源。过去在对预算外资金的管理上，基本上是自收自用，即部门、单位自行组织、自行安排使用，资金使用的随意性较大，产生了一些问题。为加强对预算外资金使用的监督，现行制度规定，对行政单位预算外收入实行财政收支两条线管理，即收入缴入财政部门在银行开设的专户，使用时向财政部门提出使用计划，经审核后拨入行政单位支出帐户，办理支出。经财政审核后拨付的预算外资金，才形成行政单位的预算外资金收入。审计时应注意检查行政单位是否按规定在银行开设收入过渡帐户和支出帐户，并将收入及时、足额缴入财政专户，有无多头开户，截留挪用、隐瞒、转移收入，坐支预算外资金等问题，是否按规定向财政部门请领预算外资金，有无虚报冒领的问题。应注意的是，行政单位在依法取得预算外资金时，这部分预算外资金并不立即形成行政单位的预算外资金收入，而应缴入财政部门在银行开设的专户，因此成为行政单位的应缴款项，属负债性质。只有当财政部门将行政单位申请的款项拨入其支出帐户时，才形成行政单位的预算外资金收入。另外，行政单位依法取得的应纳入财政预算管理的行政性收费、罚没收入、基金等，不属行政单位收入，必须按规定上缴财政。审计中应注意行政单位是否及时足额上缴上述收入，是否存在隐瞒收入、截留、占压、挪用应缴款项等问题。
(5)资产管理情况。行政单位的资产包括现金、银行存款、库存材料、暂付款等流动资产和房屋建筑物、一般设备、专用设备等固定资产。现金、银行存款等货币性资产流动性较强，易发生错弊，应作为审计的重点。主要检查会计、出纳等有关岗位是否建立了不相容的职责分工；银行存款、现金的领用报销手续是否完善；银行开户是否合规，是否存在多头开户的问题；是否存在库存现金超限额，坐支现金，超出结算起点支付现金等违反《现金管理规定》的问题；审计人员还应核对银行存款余额，并对库存现金进行监督盘点。对其他实物性资产，应检查财务部门、资产管理部门和使用部门之间责任是否明确，三者之间的职责分工能否保证所有资产变动的情况均能在有关资料上得到正确的反映；增加的资产是否及时登记入帐，是否存在购建资产作为支出核销，形成帐外资产的情况；资产的领用、核销手续是否健全；是否建立了资产的清查盘点制度，保证帐帐相符，帐实相符；资产盘盈、盘亏的处理是否符合有关规定；资产的减少是否履行报批手续，转让计价有无合法依据，是否存在低价处理国有资产的问题；固定资产的配备是否符合国家规定的标准，有无擅自提高标准的问题；审计人员可根据需要对全部或部分实物性资产进行监督盘点；对于暂付款项，要重点检查其合法性和真实性，有无擅自出借或挪用经费的问题，有无暂付款项长期不能收回的问题，必要时应向对方单位进行函询。
(6)经费使用效益。行政单位经费的使用效益主要体现为社会效益，主要有两方面的内容：一是经费的使用是否达到了预期的目的，即行政单位是否履行了其法定职责，向社会提供了有效的服务；二是经费的使用是否合理节约，有无明显不当和损失浪费的情况。
(7)财务报告和财务分析。财务报告是行政单位为向有关部门和公众报告其财务状况和预算执行结果而编制的文件。财务报告综合反映了行政单位经费使用情况和结果，是有关部门考核行政单位工作的重要依据。财务报告应真实、准确、完整地反映行政单位的财务状况和预算执行结果。审计中应将财务报告与有关帐簿记录进行核对，检查财务报告的真实性和完整性，并对财务报告的编制过程及方法进行检查，检查其正确性；还应检查行政单位是否按规定及时向有关部门报送财务报告。
行政单位还应按规定的指标和计算方法对本预算年度预算执行情况、开支水平、人员增减、固定资产利用状况等进行财务分析，并报送有关部门。审计人员应在核实有关数据真实性的基础上，对有关指标的真实性和正确性进行检查。
(二)事业单位财政财务收支审计
1.事业单位财务管理制度的主要内容。
国家对事业单位实行核定收支、定额或定项补助、超支不补、结余留用的预算管理办法，定额或定项补助标准根据事业特点、事业计划、事业单位收支状况以及国家财政政策和财力可能确定，定额或定项补助可以为零。事业单位必须根据以前年度预算执行情况、本年度收入增减因素，以及事业发展的需要和财力可能等，编制收入预算和支出预算。事业单位提出预算建议数，由主管部门汇总报财政部门核定，事业单位根据财政部门下达的预算控制数编制预算，由主管部门汇总报财政部门核定后执行。事业单位收入包括：财政补助收入、上级补助收入、事业收入、经营收入、附属单位上缴收入、其他收入等。财政补助收入是财政部门核拨给事业单位的各类事业经费；上级补助收入，是事业单位从上级单位和主管部门取得的非财政补助收入；事业收入是事业单位开展业务活动取得的收入，应注意，按照国家有关规定应当上缴财政的资金和应缴入财政专户的预算外资金，不属于事业单位资金，不计入事业收入，只有从财政专户核拨的预算外资金和部分经核准不上缴财政专户管理的预算外资金，才能计入事业收入；经营收入是指事业单位在其业务活动之外开展非独立核算经营活动取得的收入；附属单位上缴收入是事业单位独立核算的附属单位按有关规定上缴的收入；其他收入指上述收入范围之外的各项收入，如投资收益、利息收入、捐赠收入等。事业单位各项收入全部纳入单位预算，统一核算，统一管理。事业单位支出包括：事业支出、经营支出、对附属单位补助支出及上缴上级支出。事业支出即事业单位开展业务活动发生的支出，包括人员经费(工资等)、公务费、业务费、设备购置维护费等；经营支出是事业单位在开展专业业务活动之外的，非独立核算的经营活动发生的支出，这部分支出必须合理归集或分摊，并与经营收入配比；对附属单位补助支出是指事业单位用财政补助收入之外的收入对附属单位补助所发生的支出；上缴上级支出是指一些非财政补助收入大于支出较多，按规定实行收入上缴办法的事业单位按规定的比例或定额上缴上级单位的支出；事业单位从财政部门和主管部门取得的有指定项目和用途的专项经费，必须单独核算，专款专用，并定期向财政部门或主管部门报告专项资金使用情况。事业单位的年度收入与支出相抵后的余额，形成其结余，但经营收支结余必须单独反映。事业单位的结余，除专项资金结余按规定结转下年使用外，可按国家规定比例提取职工福利基金，其余部分作为事业基金用于以后年度事业发展需要。事业单位可按规定提取或设置具有专门用途的资金，即专用基金。事业单位专用基金主要有：修购基金，即按事业收入和经营收入的一定比例提取，在修缮费和设备购置费中列支，以及按其他规定转入，用于固定资产维修和购置的资金；职工福利基金，即按结余的一定比例提取及按其他规定转入，用于职工集体福利设施、集体福利待遇等的资金；医疗基金，指未纳入公费医疗经费开支范围的事业单位按财政部门规定的公费医疗开支标准从收入中提取，参照公费医疗制度有关规定用于职工公费医疗开支的资金；其他基金指除上述基金外的其他基金。
2.事业单位审计的主要内容。
事业单位财务管理在很多方面与行政单位类似，审计内容也有很多相同之处，在此不再赘述，仅就不同点介绍如下：
(1)预算管理情况。事业单位的事业收入、经营收入等是事业单位的重要收入来源，事业单位收入预算中这部分收入预算的编制是否真实、科学直接影响事业计划的完成和财政、上级补助收入的确定。审计中应注意检查事业单位是否参照以前年度预算执行情况，根据预算年度收入增减因素，合理确定收入预算，有无故意低报事业、经营等收入，骗取财政、上级补助的情况，或高报上述收入，影响事业计划完成的问题。
(2)预算执行情况。预算批复和拨款到位情况；财政部门、上级主管部门是否按规定批复预算并办理拨款，有无预算批复不及时，占压拨款的情况；事业单位的各项收入是否全部入帐并按规定纳入预算管理，统一使用，有无隐瞒、转移收入的问题；经费使用情况：事业单位是否按预算和规定的用途使用经费，有无突破预算、挪用经费的问题；各项经费的使用是否严格执行国家规定的标准，有无提高开支标准，扩大开支范围，挥霍浪费等问题；专项经费是否专款专用、单独核算并向有关部门报告经费使用情况；有预算收入上缴任务的单位是否及时足额上缴应缴预算收入，有无截留挪用的问题；事业单位成本核算是否正确，有无虚增、虚减成本的问题，各项应缴税费是否及时足额缴纳。
(3)结余及专用基金管理情况。结余的形成是否真实合法，有无虚增虚减的问题；各项专用基金的提取是否符合国家规定的标准和来源渠道；专用基金的使用是否符合规定的用途，有无挤占挪用的问题。
(4)资产管理情况。大多数事业单位要组织收入，有一定程度的经营活动，这是事业单位在业务特点上与行政单位的一个重要区别。与此相适应，事业单位在资产管理的要求上与行政单位也有所不同。从资产的种类上看，表现为事业单位有无形资产和对外投资。对无形资产，审计内容主要是：无形资产的形成和计价是否真实、正确，有无虚增无形资产价值的问题；无形资产的转让是否经过资产评估，评估的程序是否合法，方法是否正确，是否存在压低转让价的问题，转让收入是否按规定计入事业收入。对对外投资，主要审计内容有：对外投资是否合法，是否经过主管部门和财政部门批准或备案；对外投资是否真实，即投出款项是否确实用于预定用途，必要时应向被投资单位核实；以有形资产、无形资产对外投资的，是否按规定进行评估，确定投资价值，有无故意压低投资价值，侵占国有资产的情况。另外，事业单位将资产用于经营活动的，还应核算资产的使用成本，并与经营收入相配比。
(5)往来款项管理情况。往来款项指事业单位的债权、债务。往来款项是否真实、合法，核算是否正确，直接影响到事业单位财务报告的真实性，审计中应重点审查往来款项是否合法，有无挪用事业经费、专项资金或违规拆借资金等问题；
往来款项是否真实存在，有无虚列债权债务的问题，必要时应向对方单位查询；审计中还应对往来款的结算情况进行检查，督促事业单位及时催收到期债权，按期偿付债务。事业单位的负债，还包括事业单位收取的、应上缴财政预算的资金和应上缴财政专户的预算外资金、应缴税金及其他应上缴的款项，审计中应重点检查事业单位是否及时足额上缴，有无截留挪用的问题。
(6)经费使用效益。事业单位的效益可分为经济效益和社会效益。由于相当一部分事业单位主要从事物质生产活动，总的来看，对事业单位效益的评价，要比行政单位更侧重于经济效益方面。但由于事业单位在根本上是非盈利性的服务性组织，社会效益仍然是评价其效益的主要内容。对事业单位经费使用效益的评价，主要有以下内容：一是事业计划的完成情况，即事业单位是否完成了事业任务，完成情况的好坏；二是事业单位业务活动对其本身产生的经济效益，即所谓“一次效益”，主要用投入产出比来衡量；三是事业单位业务活动产生的社会效果，即“二次效益”，如某一科研项目在社会上发挥的作用，教育经费的使用为公众提供的教育服务等；四是经费的使用是否合理节约，是否存在损失浪费的问题。
(7)财务报告和财务分析。事业单位的财务报告和财务分析，只是在报表种类、具体的编制方法和分析指标上与行政单位有所不同，在此不再介绍。
(三)专项资金审计
专项资金审计是审计机关对专项资金收支的真实性、合法性和效益性进行的监督活动。专项资金是指财政预算安排的或有关部门、单位依法自行组织的，具有特定用途的财政性资金。审计机关可以根据需要，对某项专项资金的收支情况进行审计。专项资金审计只对某项资金的收支活动进行审查，一般不需要涉及被审计单位的其他财政财务收支活动。专项资金是具有专门用途的资金，必须专款专用，审计中应检查专项资金是否按规定用途使用，是否存在挤占挪用问题；专项资金是否按规定的标准使用，有无提高开支标准的问题。专项资金审计是一种专业性很强的审计，其具体内容依被审计资金的性质和管理要求而各不相同，审计人员应注意学习掌握与专项资金收支活动有关的法律、法规、政策和制度，了解其业务特点，做到具体情况具体分析。
专项资金审计针对性较强，审计结果能说明某一方面的深层次问题，是一种常用的审计方式。专项资金审计常采用行业审计的组织方式。常见的行政事业专项资金审计有教育经费审计、科技经费审计、行政性收费和罚没收入审计、计划生育经费审计等等。
各级政府经常拨款举办或资助大型文化、体育等活动，如运动会、艺术节等。国家审计中的行政事业审计部门必须对这些活动的财务收支情况进行审计监督，以确保预算资金使用的真实、合法和效益。这类审计的对象也是具有特定用途的财政专项资金，因此也可归入专项资金审计。这类审计的主要审计内容如下：
1.主办单位内部控制制度是否健全有效。
2.财政拨款是否及时足额到位。
3.主办单位自行组织收入的合法性，是否存在向企业和个人摊派的问题，收入是否及时足额入帐，有无隐瞒、挪用的问题。
4.资金使用是否符合法律法规和有关制度的规定，有无挤占挪用、提高开支标准、滥发钱物、贪污私分等问题。
5.对项目的效益进行评价。项目的效益包括社会效益和经济效益，根据项目性质的不同，评价的侧重点也有所不同。对社会效益的评价，主要是项目是否达到了预期的目的；对经济效益评价的主要内容有：收入(如门票收入、广告收入等)的组织情况，主办单位应尽最大可能组织收入，保证项目的顺利实施；支出是否合理、节约，是否存在损失、浪费的问题，等等。
(四)行业审计
审计机关可以根据需要，在其权限之内组织各级审计机关对该范围内某一相同类型的单位或某项专项资金的收支情况进行审计，称为行业审计。行业审计可以较全面地反映某一经济领域中存在的带有普遍性的问题或国家宏观经济调控政策执行中存在的问题，为国家宏观决策提供可靠的信息，具有宏观性强的特点，能够充分发挥国家审计的宏观经济监督作用，是行政事业审计中较常采用的审计组织方式。按审计对象，行业审计还可以进一步区分为对某一类型单位全面的财政财务收支审计，如医院行业审计、出版社行业审计等，和对特定的专项资金进行的审计，如教育经费审计、科技经费审计、缉私罚没收入审计、计划生育经费审计等等。
行业审计的一般程序可概括为：
1.围绕党和国家在一定时期的中心工作确定审计项目；
2.充分了解被审计对象的情况；
3.制定科学合理的审计方案并广泛征求意见；
4.形成正式审计工作方案下发到参加审计的各审计机关，并根据需要组织有针对性的学习培训；
5.各地具体实施，在此阶段，组织单位必须及时了解各地审计进展情况，及时解决审计过程中出现的问题，保证审计按计划进行；
6.各级审计机关上报材料，组织单位应视需要对各地的审计质量进行监督、考核；
7.组织单位进行综合汇总，形成综合报告并上报有关领导机关。可以看出，由于行业审计需要由各级审计机关协作完成，组织协调和综合汇总工作就成为审计过程中非常重要的环节。组织协调工作包括制定审计方案、组织审计力量、调配审计任务、控制审计进度、检查审计质量等内容。只有搞好组织协调工作，才能保证审计目标符合宏观调控要求，保证审计工作按计划顺利进行和审计目标的实现；各级审计机关的工作成果必须经过综合汇总才能形成最终的审计成果，综合汇总工作搞不好，就会成为制约审计作用发挥的“瓶颈”，甚至无法达到审计目的。组织单位必须围绕审计目的，本着“突出重点，兼顾一般”的原则尽可能全面、如实地反映各级审计机关的工作成果。在具体实施时，行业审计与对单个单位的审计并无差别，审计的重点内容也基本相同，在此不再赘述。
(五)其他审计类型
除上述主要审计类型外，行政事业审计还可以有其他一些审计类型，其主要审计内容基本已包括在上述审计类型中，在此不再介绍。
