党的十七大以来，在审计署党组的正确领导下，行政事业审计工作以科学发展观为统领，坚持“依法审计、服务大局、围绕中心、突出重点、求真务实”的工作方针，积极探索创新，不断提升水平，取得了较好成绩，实现了科学发展。
一、规范预算管理，推动预算改革，深化中央部门预算执行审计和决算（草案）审签
2008年以来，中央部门预算执行审计不断探索创新，开展按支出功能科目进行中央部门预算及其执行情况差异分析，并以附表形式在审计报告和审计结果公告中反映，把握了部门预算执行总体情况，推动了预决算信息公开；实行预算执行审计和决算（草案）审签同步实施，深化了部门预执行审计和决算（草案）审签的融合，加强了对部门决算（草案）的审计监督；开展部门本级和京外所属单位“上下联动”审计，扩大了审计覆盖面；坚持部门预算执行审计与部长、校长经济责任审计相结合，强化了对权力的制约，提高了审计监督效果。五年来，查出了部门和单位预算执行和其他财政收支中违反财经制度规定和损失浪费以及影响部门决算（草案）真实性、准确性和合规性的相关问题，揭示和反映了有关财政结转结余资金管理、基本支出定员定额管理、“三公经费”管理使用、发票报销、政府采购等方面存在的突出问题，规范了部门预算管理，深化了部门预算改革。
二、着眼宏观大局，紧扣主题主线，连续开展中央扩大内需促进经济平稳较快发展政策实施情况及效果跟踪审计
2009年至2010年，连续3次对中央扩大内需促进经济平稳较快发展政策实施情况及效果开展跟踪审计，重点调查了投资结构、环保政策、土地政策、资金安全、项目管理、建设效果等6个方面的内容，揭示和反映了一些地方在安排落实第一批新增中央投资过程中随意调整投资计划或滞留投资资金，部分项目存在以已完工工程申请、使用虚假资料申报、多头申报等方式获取中央投资等问题，有关地方和单位积极进行整改，促进了中央扩大内需政策措施的落实；4次组织开展中央财政投资“上下联动”审计，内容涉及资源、能源等领域8个专项，揭示了相关专项资金管理使用和项目建设中存在的突出问题，有效促进了有关地区和部门加快采煤沉陷区治理、提高国家物资储备库仓储能力、改进大型灌区抗旱功能和加速配套工程建设，发挥了审计服务宏观大局的建设性作用。
三、关注民生热点，突出重点资金，积极开展科教文卫等领域专项审计和审计调查
2009年以来，结合中央部门预算执行审计，开展了国家科技支撑计划项目和国家科技重大专项资金审计和审计调查，揭示和反映了部分国家科技计划项目组织实施管理滞后、科研成果充抵严重、科技资金管理使用不规范、配套资金不到位等突出问题，促进有关部门不断加强了科研制度建设和监督检查，较好地发挥了审计促进科技管理改革的积极作用；先后开展了农村义务教育经费保障机制、城市基础教育经费使用管理情况、农村初中校舍改造工程、中等职业教育基础能力建设、全国中小学校舍安全工程、农村中小学布局调整、“985工程”专项资金审计和审计调查，揭示和反映了有关学校办学收费及教育事业展等方面存在的突出问题，促进相关地方加大了农村义务教育经费投入保障力度，规范了学校办学和收费行为，推动了教育事业发展；开展了农村医疗卫生服务体系建设情况专项审计调查，揭示和反映了部分地方卫生队伍建设相对滞后，一些项目建设资金管理使用和建设程序不符合规定，部分医疗机构违反规定加价售药，医疗废物亟待治理等突出问题，推动了项目建设和农村医疗卫生事业发展。
四、突破发展瓶颈，持续大力推进，推动联网审计工作再上新台阶
2008年以来，中央部门预算执行审计等工作适应审计信息化发展要求，不断加大联网审计推进力度，通过构建和扩大联网审计工作平台，加强对已联网51个中央部门本级的经常性监督，将其中37个部门联网范围扩大到所属二、三级单位，有效实现审计覆盖面的纵向延伸；完成了《中央部门预算执行审计数据规划》和《中央部门预算执行计算机审计方法体系》的编制工作，为联网审计工作提供了重要的技术指导；强化中央部门预算执行审计数据库建设，数据覆盖2008至2011年4个预算年度，部门扩大到96个；完善了中央部门预算执行联网审计系统。
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