为进一步推动完善国家治理，发挥审计的“免疫系统”功能，2012年初，报经审计署领导同意，行政事业审计司紧密结合审计实践，围绕充实项目储备与提升工作层次，组织25个派出审计局，选择审计管辖部门的部分重大政策与规划贯彻落实情况、重点领域事业发展情况和重大项目实施情况，开展36个专题研究，其中：行政事业审计司选择了教育、科技、文化、卫生等领域10个课题，组织派出审计局的处长、业务骨干以及行政事业审计司同志，利用业余时间进行专题研究。专题研究内容要求侧重三个方面，一是侧重研究历史沿革和现状，二是侧重通过研究来梳理问题，三是侧重研究改革的方向、目标和路径。上述36个专题研究成果经专家论证后，将进入审计项目库，作为以后年度开展审计项目的储备。
    
    以专题研究指导审计实践的方式，不但能提高审计项目选择与确立的科学性，还能培养行政事业审计司和派出审计局审计人员分析问题、研究问题的能力，并提高业务素质和文字综合水平，提升审计工作层次。行政事业审计司将着力推动审计理论与实践的有机结合，坚持开展研究型审计，以审计研究成果推动审计事业的科学发展。

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